Tom Sullivan og Paul Harris er studenter ved Princeton-universitetet og jobber med å bli ferdig med studiene. Samtidig er de farlig nær å løse mysteriene i Hypnerotomachia Poliphili, en mye omtalt bok fra 1499. De to vennene jobber seg gjennom kodene og gåtene som skjuler seg i boken og ser plutselig teksten i et helt annet lys. Boken inneholder en historie om tro, kjærlighet og vitenskap, men er samtidig en matematisk labyrint. Bokens gåter har ødelagt familier og vennskap, og minst en person er blitt drept for å ha visst for mye. Tom og Paul vet enda mer og innser at dette kan være farlig. Boken tar oss med tilbake til Roma på 1400-tallet og videre frem til livet ved de fineste universitetene i USA, fra et 500 år gammelt mord til oppvekstproblemer.
